Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Amd1P0DMN7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms