Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ly6c1P0CW02 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ly6c1P0CW02 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms