Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UbbP0CG49 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UbbP0CG49 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UbbP0CG49 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms