Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Surf1P09925 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Surf1P09925 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Surf1P09925 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Surf1P09925 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Surf1P09925 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Surf1P09925 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Surf1P09925 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Surf1P09925 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Surf1P09925 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Surf1P09925 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms