Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtaP09225 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtaP09225 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtaP09225 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtaP09225 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtaP09225 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtaP09225 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LtaP09225 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtaP09225 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtaP09225 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtaP09225 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtaP09225 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtaP09225 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtaP09225 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtaP09225 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtaP09225 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtaP09225 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtaP09225 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LtaP09225 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LtaP09225 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtaP09225 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtaP09225 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtaP09225 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtaP09225 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtaP09225 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LtaP09225 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtaP09225 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtaP09225 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtaP09225 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtaP09225 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtaP09225 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtaP09225 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtaP09225 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LtaP09225 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtaP09225 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtaP09225 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtaP09225 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtaP09225 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtaP09225 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtaP09225 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtaP09225 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtaP09225 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtaP09225 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtaP09225 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtaP09225 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtaP09225 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtaP09225 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtaP09225 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtaP09225 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtaP09225 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtaP09225 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtaP09225 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtaP09225 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtaP09225 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtaP09225 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LtaP09225 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtaP09225 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtaP09225 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtaP09225 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtaP09225 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtaP09225 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtaP09225 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtaP09225 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LtaP09225 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtaP09225 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtaP09225 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtaP09225 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtaP09225 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtaP09225 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtaP09225 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms