Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pax1P09084 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax1P09084 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax1P09084 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax1P09084 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms