Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa1P09022 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms