Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa5P09021 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa5P09021 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms