Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TnfP06804 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TnfP06804 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TnfP06804 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TnfP06804 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TnfP06804 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TnfP06804 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TnfP06804 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TnfP06804 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TnfP06804 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TnfP06804 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TnfP06804 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TnfP06804 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TnfP06804 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TnfP06804 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TnfP06804 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TnfP06804 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TnfP06804 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TnfP06804 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TnfP06804 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TnfP06804 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TnfP06804 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TnfP06804 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TnfP06804 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TnfP06804 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TnfP06804 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TnfP06804 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TnfP06804 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TnfP06804 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TnfP06804 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TnfP06804 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TnfP06804 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TnfP06804 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TnfP06804 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TnfP06804 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TnfP06804 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TnfP06804 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnfP06804 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnfP06804 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnfP06804 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnfP06804 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnfP06804 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TnfP06804 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnfP06804 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnfP06804 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnfP06804 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnfP06804 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnfP06804 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TnfP06804 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnfP06804 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnfP06804 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TnfP06804 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TnfP06804 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnfP06804 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnfP06804 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnfP06804 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnfP06804 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnfP06804 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnfP06804 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnfP06804 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TnfP06804 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnfP06804 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TnfP06804 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnfP06804 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnfP06804 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnfP06804 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnfP06804 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnfP06804 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnfP06804 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnfP06804 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TnfP06804 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnfP06804 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TnfP06804 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TnfP06804 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TnfP06804 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TnfP06804 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TnfP06804 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TnfP06804 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TnfP06804 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TnfP06804 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TnfP06804 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TnfP06804 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TnfP06804 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TnfP06804 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TnfP06804 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TnfP06804 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TnfP06804 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TnfP06804 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms