Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06323 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06323 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06323 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06323 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06323 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06323 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06323 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06323 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06323 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06323 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06323 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06323 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06323 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06323 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06323 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06323 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06323 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06323 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06323 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06323 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06323 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06323 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06323 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06323 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06323 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06323 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06323 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06323 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06323 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06323 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06323 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06323 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06323 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06323 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06323 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06323 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06323 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06323 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06323 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06323 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06323 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06323 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06323 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06323 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06323 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06323 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P06323 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06323 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06323 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06323 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P06323 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06323 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06323 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06323 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06323 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06323 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06323 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P06323 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06323 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06323 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06323 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06323 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06323 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06323 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06323 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P06323 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P06323 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms