Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd3dP04235 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd3dP04235 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd3dP04235 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms