Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-Eb1P04230 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
H2-Eb1P04230 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Eb1P04230 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms