Protein–RNA interactions for Protein: P02469

Lamb1, Laminin subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb1P02469 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lamb1P02469 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamb1P02469 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamb1P02469 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamb1P02469 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamb1P02469 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb1P02469 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb1P02469 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb1P02469 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb1P02469 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb1P02469 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb1P02469 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb1P02469 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb1P02469 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb1P02469 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms