Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01853 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01853 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01853 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01853 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01853 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01853 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01853 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01853 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01853 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01853 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01853 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01853 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01853 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01853 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01853 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01853 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01853 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01853 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01853 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01853 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01853 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01853 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01853 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01853 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01853 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01853 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01853 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01853 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01853 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01853 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01853 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01853 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01853 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01853 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01853 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01853 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01853 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01853 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01853 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01853 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01853 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01853 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01853 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms