Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01820 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01820 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01820 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01820 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01820 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01820 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01820 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01820 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01820 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01820 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01820 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01820 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01820 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01820 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01820 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01820 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01820 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01820 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01820 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01820 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01820 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01820 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01820 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01820 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01820 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01820 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01820 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01820 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01820 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01820 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01820 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01820 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01820 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01820 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01820 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01820 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01820 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms