Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01790 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01790 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01790 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01790 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01790 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01790 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01790 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01790 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01790 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01790 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01790 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01790 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01790 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01790 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01790 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01790 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01790 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01790 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01790 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01790 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01790 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01790 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01790 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01790 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01790 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01790 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01790 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01790 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01790 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01790 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01790 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01790 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01790 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01790 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01790 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01790 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01790 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01790 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01790 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01790 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01790 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01790 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01790 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01790 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01790 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01790 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01790 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01790 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01790 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01790 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01790 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01790 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01790 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01790 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01790 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01790 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01790 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01790 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01790 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01790 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01790 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01790 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01790 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms