Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01788 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01788 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01788 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01788 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01788 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01788 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01788 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01788 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01788 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01788 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01788 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01788 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01788 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01788 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01788 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01788 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01788 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01788 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01788 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01788 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01788 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01788 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01788 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01788 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01788 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01788 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01788 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P01788 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01788 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01788 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01788 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01788 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01788 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01788 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01788 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01788 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01788 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01788 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01788 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01788 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01788 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01788 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01788 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01788 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01788 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01788 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01788 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01788 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01788 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms