Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01748 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01748 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01748 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01748 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01748 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01748 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01748 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01748 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01748 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01748 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01748 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01748 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01748 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01748 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01748 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01748 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01748 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01748 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01748 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01748 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01748 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01748 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01748 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01748 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01748 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01748 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01748 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01748 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01748 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01748 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01748 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01748 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01748 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01748 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01748 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01748 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01748 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01748 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01748 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01748 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01748 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01748 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01748 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01748 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01748 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01748 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01748 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms