Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01727 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01727 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01727 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01727 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01727 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01727 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01727 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01727 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01727 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01727 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01727 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01727 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01727 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01727 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01727 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01727 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01727 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01727 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01727 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01727 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01727 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01727 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01727 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01727 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01727 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01727 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01727 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01727 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01727 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01727 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01727 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01727 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01727 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01727 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01727 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01727 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01727 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01727 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01727 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01727 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
P01727 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01727 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01727 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01727 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01727 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01727 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01727 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01727 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01727 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01727 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01727 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01727 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01727 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01727 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01727 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01727 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01727 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01727 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01727 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01727 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01727 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01727 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01727 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01727 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms