Protein–RNA interactions for Protein: P01676

Ig kappa chain V-VI region XRPC 24, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01676 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01676 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01676 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01676 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01676 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01676 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
P01676 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01676 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01676 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01676 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01676 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P01676 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01676 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01676 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01676 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01676 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01676 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01676 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01676 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01676 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01676 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
P01676 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
P01676 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
P01676 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
P01676 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
P01676 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
P01676 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
P01676 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
P01676 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01676 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01676 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01676 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01676 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01676 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01676 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01676 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01676 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01676 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P01676 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
P01676 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01676 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01676 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01676 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01676 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01676 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01676 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01676 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
P01676 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
P01676 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
P01676 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
P01676 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
P01676 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
P01676 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
P01676 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01676 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01676 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01676 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01676 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01676 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01676 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01676 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01676 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P01676 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01676 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01676 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01676 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01676 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01676 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
P01676 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01676 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P01676 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01676 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01676 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01676 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01676 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01676 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01676 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01676 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01676 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01676 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
P01676 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01676 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P01676 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01676 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01676 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01676 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01676 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01676 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
P01676 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
P01676 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
P01676 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
P01676 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
P01676 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01676 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01676 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01676 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01676 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01676 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01676 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P01676 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms