Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01636 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01636 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01636 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01636 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01636 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01636 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
P01636 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01636 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01636 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01636 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01636 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01636 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01636 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01636 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01636 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01636 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01636 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01636 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01636 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01636 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01636 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01636 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
P01636 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01636 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01636 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01636 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01636 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01636 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01636 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01636 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01636 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01636 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01636 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01636 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01636 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01636 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01636 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01636 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01636 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01636 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01636 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01636 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01636 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01636 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01636 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01636 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01636 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01636 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01636 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01636 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01636 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01636 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01636 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01636 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01636 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01636 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01636 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01636 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01636 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01636 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01636 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01636 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01636 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
P01636 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P01636 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P01636 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
P01636 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01636 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01636 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01636 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01636 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
P01636 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01636 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01636 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01636 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01636 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01636 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
P01636 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01636 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
P01636 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01636 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01636 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
P01636 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01636 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01636 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01636 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms