Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abl1P00520 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abl1P00520 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abl1P00520 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abl1P00520 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abl1P00520 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abl1P00520 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Abl1P00520 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abl1P00520 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abl1P00520 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms