Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp1O89090 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sp1O89090 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp1O89090 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp1O89090 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp1O89090 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp1O89090 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp1O89090 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp1O89090 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp1O89090 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp1O89090 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp1O89090 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sp1O89090 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp1O89090 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp1O89090 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp1O89090 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp1O89090 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp1O89090 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms