Protein–RNA interactions for Protein: O89084

Pde4a, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4aO89084 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pde4aO89084 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pde4aO89084 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde4aO89084 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms