Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Robo1O89026 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Robo1O89026 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo1O89026 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo1O89026 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Robo1O89026 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Robo1O89026 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Robo1O89026 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Robo1O89026 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Robo1O89026 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo1O89026 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo1O89026 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo1O89026 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Robo1O89026 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Robo1O89026 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Robo1O89026 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Robo1O89026 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Robo1O89026 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Robo1O89026 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms