Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apaf1O88879 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Apaf1O88879 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apaf1O88879 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms