Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tom1O88746 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tom1O88746 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tom1O88746 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tom1O88746 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tom1O88746 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tom1O88746 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tom1O88746 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tom1O88746 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tom1O88746 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tom1O88746 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tom1O88746 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tom1O88746 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tom1O88746 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tom1O88746 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Tom1O88746 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Tom1O88746 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Tom1O88746 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tom1O88746 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Tom1O88746 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tom1O88746 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Tom1O88746 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tom1O88746 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Tom1O88746 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tom1O88746 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tom1O88746 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tom1O88746 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tom1O88746 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tom1O88746 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tom1O88746 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tom1O88746 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Tom1O88746 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Tom1O88746 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tom1O88746 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tom1O88746 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tom1O88746 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tom1O88746 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tom1O88746 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tom1O88746 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Tom1O88746 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tom1O88746 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tom1O88746 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tom1O88746 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tom1O88746 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tom1O88746 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tom1O88746 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tom1O88746 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tom1O88746 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tom1O88746 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Tom1O88746 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tom1O88746 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tom1O88746 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tom1O88746 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tom1O88746 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tom1O88746 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tom1O88746 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms