Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dnmt3bO88509 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Dnmt3bO88509 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms