Protein–RNA interactions for Protein: O88491

Nsd1, Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd1O88491 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nsd1O88491 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsd1O88491 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsd1O88491 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsd1O88491 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nsd1O88491 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsd1O88491 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsd1O88491 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nsd1O88491 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nsd1O88491 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsd1O88491 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Nsd1O88491 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsd1O88491 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsd1O88491 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nsd1O88491 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nsd1O88491 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nsd1O88491 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nsd1O88491 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nsd1O88491 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsd1O88491 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nsd1O88491 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nsd1O88491 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nsd1O88491 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsd1O88491 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsd1O88491 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsd1O88491 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nsd1O88491 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nsd1O88491 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsd1O88491 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsd1O88491 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsd1O88491 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsd1O88491 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsd1O88491 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsd1O88491 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsd1O88491 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsd1O88491 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsd1O88491 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsd1O88491 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms