Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme6O88425 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme6O88425 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nme6O88425 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme6O88425 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme6O88425 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme6O88425 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme6O88425 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms