Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srpk1O70551 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srpk1O70551 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srpk1O70551 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srpk1O70551 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srpk1O70551 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srpk1O70551 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srpk1O70551 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srpk1O70551 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srpk1O70551 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms