Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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Hcn4O70507 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Hcn4O70507 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Hcn4O70507 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Hcn4O70507 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Hcn4O70507 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcn4O70507 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Hcn4O70507 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Hcn4O70507 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Hcn4O70507 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Hcn4O70507 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
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Hcn4O70507 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Hcn4O70507 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Hcn4O70507 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn4O70507 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hcn4O70507 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hcn4O70507 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Hcn4O70507 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn4O70507 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
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