Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx7O70439 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx7O70439 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx7O70439 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx7O70439 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx7O70439 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx7O70439 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx7O70439 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx7O70439 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Stx7O70439 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx7O70439 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx7O70439 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx7O70439 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms