Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nptx2O70340 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nptx2O70340 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nptx2O70340 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms