Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ChkbO55229 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkbO55229 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkbO55229 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkbO55229 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ChkbO55229 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ChkbO55229 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms