Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OtogO55225 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OtogO55225 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OtogO55225 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OtogO55225 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OtogO55225 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OtogO55225 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OtogO55225 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OtogO55225 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OtogO55225 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OtogO55225 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtogO55225 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtogO55225 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtogO55225 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtogO55225 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtogO55225 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtogO55225 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
OtogO55225 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtogO55225 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
OtogO55225 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtogO55225 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
OtogO55225 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtogO55225 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtogO55225 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
OtogO55225 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OtogO55225 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
OtogO55225 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtogO55225 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtogO55225 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtogO55225 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtogO55225 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtogO55225 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
OtogO55225 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
OtogO55225 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtogO55225 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtogO55225 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtogO55225 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtogO55225 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtogO55225 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtogO55225 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtogO55225 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
OtogO55225 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
OtogO55225 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtogO55225 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtogO55225 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtogO55225 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtogO55225 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtogO55225 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtogO55225 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtogO55225 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtogO55225 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtogO55225 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtogO55225 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtogO55225 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtogO55225 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtogO55225 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtogO55225 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtogO55225 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtogO55225 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtogO55225 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtogO55225 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtogO55225 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtogO55225 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtogO55225 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtogO55225 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtogO55225 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtogO55225 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtogO55225 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtogO55225 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms