Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptpn20O55082 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptpn20O55082 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptpn20O55082 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptpn20O55082 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptpn20O55082 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptpn20O55082 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptpn20O55082 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptpn20O55082 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms