Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Bnip3O55003 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms