Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pole2O54956 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pole2O54956 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pole2O54956 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pole2O54956 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pole2O54956 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pole2O54956 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pole2O54956 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms