Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sema6bO54951 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sema6bO54951 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sema6bO54951 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sema6bO54951 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sema6bO54951 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sema6bO54951 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sema6bO54951 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema6bO54951 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms