Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TsksO54887 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TsksO54887 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TsksO54887 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TsksO54887 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TsksO54887 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TsksO54887 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TsksO54887 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TsksO54887 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TsksO54887 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TsksO54887 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TsksO54887 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TsksO54887 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TsksO54887 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TsksO54887 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TsksO54887 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TsksO54887 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TsksO54887 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TsksO54887 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TsksO54887 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TsksO54887 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TsksO54887 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TsksO54887 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TsksO54887 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TsksO54887 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TsksO54887 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TsksO54887 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TsksO54887 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TsksO54887 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TsksO54887 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TsksO54887 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TsksO54887 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TsksO54887 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TsksO54887 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TsksO54887 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TsksO54887 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TsksO54887 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TsksO54887 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TsksO54887 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TsksO54887 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TsksO54887 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TsksO54887 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TsksO54887 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TsksO54887 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TsksO54887 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TsksO54887 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TsksO54887 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TsksO54887 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TsksO54887 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TsksO54887 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TsksO54887 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TsksO54887 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TsksO54887 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TsksO54887 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TsksO54887 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TsksO54887 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TsksO54887 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TsksO54887 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TsksO54887 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TsksO54887 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TsksO54887 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TsksO54887 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TsksO54887 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TsksO54887 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TsksO54887 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TsksO54887 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TsksO54887 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TsksO54887 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TsksO54887 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TsksO54887 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TsksO54887 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TsksO54887 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TsksO54887 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TsksO54887 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TsksO54887 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TsksO54887 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TsksO54887 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TsksO54887 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TsksO54887 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TsksO54887 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TsksO54887 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TsksO54887 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TsksO54887 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TsksO54887 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TsksO54887 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TsksO54887 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms