Protein–RNA interactions for Protein: O35984

Pbx2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx2O35984 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pbx2O35984 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pbx2O35984 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pbx2O35984 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms