Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
FxnO35943 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FxnO35943 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FxnO35943 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FxnO35943 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FxnO35943 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FxnO35943 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FxnO35943 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FxnO35943 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FxnO35943 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FxnO35943 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FxnO35943 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FxnO35943 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FxnO35943 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FxnO35943 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FxnO35943 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FxnO35943 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FxnO35943 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FxnO35943 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FxnO35943 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FxnO35943 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FxnO35943 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FxnO35943 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FxnO35943 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FxnO35943 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FxnO35943 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FxnO35943 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FxnO35943 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FxnO35943 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FxnO35943 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FxnO35943 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FxnO35943 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FxnO35943 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FxnO35943 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FxnO35943 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FxnO35943 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FxnO35943 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FxnO35943 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FxnO35943 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FxnO35943 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FxnO35943 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FxnO35943 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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FxnO35943 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FxnO35943 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FxnO35943 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FxnO35943 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FxnO35943 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FxnO35943 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FxnO35943 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FxnO35943 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FxnO35943 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FxnO35943 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FxnO35943 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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FxnO35943 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FxnO35943 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FxnO35943 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FxnO35943 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FxnO35943 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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FxnO35943 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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FxnO35943 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FxnO35943 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FxnO35943 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FxnO35943 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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FxnO35943 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FxnO35943 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FxnO35943 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FxnO35943 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FxnO35943 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FxnO35943 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FxnO35943 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FxnO35943 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FxnO35943 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FxnO35943 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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FxnO35943 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FxnO35943 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FxnO35943 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FxnO35943 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FxnO35943 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FxnO35943 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FxnO35943 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FxnO35943 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FxnO35943 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FxnO35943 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FxnO35943 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FxnO35943 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FxnO35943 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FxnO35943 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FxnO35943 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FxnO35943 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms