Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cdk5r2O35926 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdk5r2O35926 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms