Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SpibO35906 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SpibO35906 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SpibO35906 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpibO35906 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpibO35906 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpibO35906 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpibO35906 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpibO35906 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SpibO35906 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpibO35906 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SpibO35906 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SpibO35906 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SpibO35906 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SpibO35906 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SpibO35906 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpibO35906 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpibO35906 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SpibO35906 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SpibO35906 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpibO35906 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SpibO35906 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SpibO35906 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SpibO35906 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SpibO35906 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SpibO35906 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SpibO35906 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SpibO35906 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SpibO35906 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpibO35906 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpibO35906 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpibO35906 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpibO35906 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpibO35906 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpibO35906 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SpibO35906 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpibO35906 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpibO35906 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SpibO35906 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpibO35906 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SpibO35906 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpibO35906 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpibO35906 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpibO35906 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpibO35906 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SpibO35906 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpibO35906 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpibO35906 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpibO35906 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpibO35906 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpibO35906 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpibO35906 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpibO35906 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpibO35906 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpibO35906 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpibO35906 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpibO35906 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SpibO35906 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SpibO35906 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SpibO35906 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SpibO35906 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SpibO35906 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SpibO35906 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SpibO35906 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SpibO35906 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SpibO35906 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SpibO35906 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SpibO35906 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SpibO35906 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SpibO35906 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SpibO35906 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SpibO35906 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpibO35906 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpibO35906 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpibO35906 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpibO35906 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpibO35906 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpibO35906 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpibO35906 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpibO35906 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpibO35906 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpibO35906 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpibO35906 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpibO35906 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpibO35906 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpibO35906 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpibO35906 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpibO35906 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms