Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaluO35887 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaluO35887 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CaluO35887 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CaluO35887 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CaluO35887 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CaluO35887 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CaluO35887 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CaluO35887 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CaluO35887 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CaluO35887 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CaluO35887 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CaluO35887 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CaluO35887 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CaluO35887 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CaluO35887 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CaluO35887 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CaluO35887 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CaluO35887 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CaluO35887 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CaluO35887 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CaluO35887 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CaluO35887 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CaluO35887 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CaluO35887 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CaluO35887 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CaluO35887 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CaluO35887 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CaluO35887 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CaluO35887 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CaluO35887 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CaluO35887 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CaluO35887 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CaluO35887 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaluO35887 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaluO35887 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaluO35887 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaluO35887 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaluO35887 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaluO35887 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaluO35887 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaluO35887 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaluO35887 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaluO35887 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CaluO35887 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CaluO35887 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CaluO35887 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CaluO35887 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CaluO35887 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CaluO35887 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CaluO35887 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CaluO35887 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CaluO35887 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CaluO35887 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CaluO35887 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CaluO35887 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CaluO35887 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CaluO35887 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CaluO35887 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CaluO35887 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaluO35887 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaluO35887 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaluO35887 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaluO35887 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaluO35887 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaluO35887 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaluO35887 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaluO35887 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaluO35887 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CaluO35887 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaluO35887 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaluO35887 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaluO35887 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaluO35887 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaluO35887 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaluO35887 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaluO35887 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CaluO35887 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaluO35887 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CaluO35887 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CaluO35887 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CaluO35887 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CaluO35887 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CaluO35887 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CaluO35887 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaluO35887 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaluO35887 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaluO35887 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaluO35887 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaluO35887 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaluO35887 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaluO35887 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaluO35887 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaluO35887 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaluO35887 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaluO35887 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaluO35887 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaluO35887 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms