Protein–RNA interactions for Protein: O35648

Cetn3, Centrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cetn3O35648 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cetn3O35648 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cetn3O35648 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms