Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema6aO35464 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema6aO35464 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema6aO35464 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms