Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TnxbO35452 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TnxbO35452 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnxbO35452 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnxbO35452 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnxbO35452 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnxbO35452 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnxbO35452 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnxbO35452 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TnxbO35452 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TnxbO35452 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TnxbO35452 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TnxbO35452 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TnxbO35452 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnxbO35452 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TnxbO35452 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms