Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sh2d1bO35324 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sh2d1bO35324 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms